我觉得首先要给楼主来区分一下
台湾的国语 一般来说指两种意思
1。 本土台湾人也就是带闽南话口音的国语
2。 以49年来台的外省人为主逐渐形成的国语口音（相对于大陆普通话而言）
前一种很正常，就象东北人说的是带东北音的国语，
上海人说的是带上海腔的国语，四川人说带川音的国语；
各地的人都是如此。。。
后一种以外省人为主导的正统国语口音，为何会和大陆的普通话不同呢。
我个人看法，当年国民政府修订的国语音调大致就是如此的，
49后在台湾发扬光大而已。如果你看一些上世纪30，40年代的中国电影
你就会发现当时国语和现在台湾版普通话比较类似。
而49年后大陆的普通话，经过了拚音等文字改革
在口音上更偏重于北方模式.
比较有意思的是大陆台湾的几代领导人国语说的都极不标准
到马胡才算是终于会说了